La Confederazione è rappresentata in una serie di programmi della Commissione europea come METNET, EMRF, MARNIS e SAGMAS ed è coinvolta nella Carta dell'industria marittima di qualità e nel gruppo di pianificazione del Forum delle industrie marittime dell'UE. Oltre a studiare e presentare i problemi operativi del settore marittimo dell'UE, il CESMA fornisce anche consulenza sugli aspetti pratici del trasporto marittimo. Il Segretariato dell'organizzazione, che è completamente indipendente e opera su base onoraria, ha sede nei Paesi Bassi, ad Amsterdam, presso la sede del Royal College Zeemanshoop. Il CESMA ha filiali in altre quindici località dell'UE di cui 2 a Genova, una a Trieste e una a Loano.
La presidenza del Collegio Capitani è membro e rappresentante dell’associazione.